许多系统都等电路设计完成之后再作考虑散热风扇的选用，这时可能己造成先天限制而无法在散热效果上得到满意，较恰当的做法应该是在设计阶段将风扇列入考虑，而不是事后再作补救。
1.气流方式:散热风扇有吹风和抽气两种，其优缺点对比如下:
防尘比较: 采用吹风式防尘方案，便于在入口处安装防尘方案，防止灰尘进入系统，并且由于系统处于较高的气压下，系统会吹出所有间隙，还起到防尘作用。
冷却比较：散热风扇将风扇的热量引入系统，而泵送风扇将所有热量从风扇发送到外部世界。
操作系统温度的比较：散热风扇在较低环境温度下操作，所以我们能有一个较长的寿命，抽气式风扇的操作进行温度高，寿命研究相对短。
气流比较：风机在气流吸气部分吸气平均，吸风气流较集中，便于设计人员选择散热区加强吹风。
2.干扰问题
由于电流开关和线圈电感，直流风扇在运行时会产生导电 ，设计人员要注意公共电源线路的任何干扰。如果散热风扇在严重的环境中工作，则需要考虑某些部件受到振幅干扰的可能性，此外，永磁和线圈可能有少量磁场溢出，也就是说，如果靠近某些敏感电路，可能会对系统造成干扰，为风扇制造商提供良好的联动管理外壳是风扇制造商的责任，但从用户的角度来看，为风扇选择合适的位置是减少干扰的有效方法。
3.降低管理系统进行噪音的原则
减少风阻，使更大和更快的风扇不需要冷却的目的。
减少流场干扰，降低湍流而产生的噪音
在相同的风量需求情况之下，尽量可以选用不同尺寸大而转速小的风扇。
风扇和系统采用柔软、柔韧的隔振材料，避免振动噪音。
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